染色体畸变是引起染色体病的根本原因。如果是常染色体病患者，多伴有较严重的生长发育障碍、智力障碍和多发性畸形。如21三体综合征（又称先天愚型），就是在21号染色体上多了一条，在高龄孕妇中的发生率明显增高，主要原因就与卵龄老化有关。
染色体变异的原因较为明确的有电离辐射、遗传、化学药物和毒物等。有些生物因素，如风疹和肋腺炎等病毒也可致畸变。
父母生育时年龄过大，尤其是35岁以上的母亲，由于生殖细胞在母体内停留时间过久，受各种因素影响的机会过久，受各种因素影响的机会增多，在以后发生的减数分裂过程中，容易产生染色体不分离而引起数目异常。
