男性不育与免疫有密切的关系，即由免疫紊乱导致免疫不育。在免疫不育中，其中主要作用是精子抗原与精子抗体。所谓免疫，是机体识别和排斥抗原，借以维持机体平衡的一种功能。
正常生理情况下，精子对男性而言，是一种隐蔽抗原，自身的免疫系统不会对精子产生排斥，两者相安无事。但在生殖器感染、手术、外伤等某种病理情况下，破坏了这种平衡与保护机制，免疫系统可对自身精子产生自身抗体，及抗精子抗体。抗精子抗体一般存在于血精、精浆，也可以存在精子表面。可以经过有关化验检测得知。
一旦产生抗精子抗体，就可能影响精子功能、干扰受精。比如可影响精子活力、抑制精子获能、影响精子和与卵子结合、影响胚胎发育等，最终导致男性不育。